10 meilleurs logiciels de facturation européens pour PME et indépendants en 2026

En France, le logiciel de facturation a changé de statut : ce n’est plus un simple confort de gestion, c’est devenu une échéance. À partir du 1er septembre 2026, une facture entre professionnels devra transiter par une Plateforme Agréée par l’administration, et un outil qui n’y est pas raccordé ne pourra tout bonnement plus servir à facturer en B2B.

Le calendrier est progressif : réception pour toutes les entreprises et émission pour les grandes et les ETI en 2026, émission pour les PME et TPE en 2027. Le choix de l’outil, longtemps reportable, a donc pris un caractère d’urgence.

Les dix logiciels de facturation européens réunis ici sont tous prêts pour l’échéance, édités et hébergés dans l’Union. Au-delà de la conformité, ils se départagent sur l’essentiel : facturation simple, gestion commerciale, comptabilité intégrée, collaboration avec l’expert-comptable. Fiches détaillées et tarifs vérifiés à l’appui.

Comment ces outils ont été sélectionnés

Chaque logiciel retenu répond à cinq critères : entité juridique et hébergement des données dans l’Union européenne (conformité RGPD), conformité à la réforme de facturation électronique 2026 (PDP immatriculée ou Plateforme Agréée partenaire), tarif accessible aux TPE et PME françaises, version gratuite ou essai sans carte bancaire, et fonctionnalités de base vérifiées sur les pages éditeur. Les solutions purement enterprise ou centrées sur les dépenses fournisseurs (AP) sont restées hors périmètre.

Tableau comparatif

Outil	Note	Point fort	À partir de	Essai gratuit	Site	Fiche
Pennylane	3,9/5	Collaboration expert-comptable en temps réel	14 € par mois	Oui	pennylane.com	Voir la fiche
Evoliz	4,0/5	Double certification NF, hébergement France	29 € par mois	15 jours sans CB	evoliz.com	Voir la fiche
Henrri	3,5/5	Plan gratuit permanent et illimité	Gratuit	Oui (plan Free)	henrri.com	Voir la fiche
Tiime	4,0/5	PDP immatriculée DGFiP, facturation illimitée gratuite	Gratuit	Oui (plan Free)	tiime.fr	Voir la fiche
Axonaut	3,9/5	ERP léger tout-en-un, fonctionnalités illimitées dès le premier plan	48,50 € par mois	Oui	axonaut.com	Voir la fiche
Sellsy	3,7/5	Facturation + CRM nativement intégrés	39 € par mois	Oui	sellsy.com	Voir la fiche
Karlia	3,6/5	CRM, facturation et trésorerie réunis	29 € HT par mois	Oui (sans CB)	karlia.co	Voir la fiche
Indy	4,0/5	Compta + facturation pour indépendants	Gratuit	Oui (plan gratuit)	indy.fr	Voir la fiche
Teamleader	3,5/5	CRM, devis et projets pour PME	37,50 € par mois	Oui	teamleader.eu	Voir la fiche
Shine Facture	3,8/5	Facturation simple, plan gratuit	Gratuit	Oui (plan Free)	shine.fr	Voir la fiche
Finom	3,9/5	Compte professionnel et facturation réunis	Gratuit	Oui	finom.co	Voir la fiche
Fonoa	3,4/5	Automatisation de la TVA et de la facturation électronique par API	Sur devis	Démo	fonoa.com	Voir la fiche
iPaidThat	3,4/5	OCR des factures fournisseurs, plateforme agréée	59 € par mois	Oui	ipaidthat.io	Voir la fiche
Kolecto	3,6/5	Tout-en-un achats, ventes et trésorerie, plateforme agréée	12 € par mois	Oui	kolecto.fr	Voir la fiche

Finom, Fonoa et iPaidThat complètent l’annuaire sur des usages plus spécialisés (compte pro et facturation, automatisation de la TVA par API, traitement des factures fournisseurs) : leurs fiches en détaillent le positionnement et les tarifs. Kolecto s’y ajoute, plateforme agréée par la DGFiP adossée au groupe Crédit Agricole, avec une offre réunissant achats, ventes et trésorerie et gratuite la première année pour un créateur d’entreprise.

Pennylane : à partir de 14 € par mois

Pennylane est la solution la plus implantée dans les PME françaises suivies par un expert-comptable. Facturation, synchronisation bancaire et production comptable cohabitent dans une même interface : le dirigeant et son cabinet travaillent sur les mêmes données, en temps réel, sans le moindre échange de fichiers. La synchronisation via API PSD2 couvre presque toutes les banques françaises et européennes, néobanques comprises (Qonto, Shine, N26) ; les factures émises sont conformes Factur-X ; et Pennylane est immatriculée PDP auprès de la DGFiP, ce qui veut dire que la facturation électronique B2B y est gérée en propre, sans passer par un tiers. Certification ISO 27001 et hébergement dans l’UE achèvent le volet souveraineté.

Un micro-entrepreneur encore sans expert-comptable passera à côté de l’essentiel, puisque toute la valeur de l’outil naît de la collaboration avec le cabinet. Pour l’entreprise déjà accompagnée (une SASU ou une SARL de services de 3 à 20 personnes qui veut suivre sa trésorerie au jour le jour sans rien exporter en fin de mois), le calcul est tout autre. Comptez 14 € par mois pour le plan Basique (facturation, synchronisation bancaire), 24 € pour l’Essentiel (relances automatiques, plus de 60 intégrations, budget prévisionnel) et 79 € pour le Premium (production comptable, liasse fiscale, révision). Ce dernier étant souvent réservé aux cabinets partenaires, vérifiez l’accès direct avant de vous décider.

3,9/5Note Eurosaas

Evoliz : à partir de 29 € par mois

Installé à La Garde (Var), Evoliz vise les artisans, commerçants et prestataires qui veulent remplacer le trio tableur, logiciel de facturation et outil bancaire séparés. Sa double certification NF203 et NF525, rare sur le marché français, couvre les obligations de la loi anti-fraude TVA et fait l’objet d’un audit annuel. La Plateforme Agréée DGFiP est incluse dans toutes les formules, la moins chère comprise, avec prise en charge du Factur-X à l’émission comme à la réception, et le traitement des factures fournisseurs par OCR (500 documents par mois en formule Essentielle) évite la ressaisie. L’éditeur a rejoint le groupe européen Visma en 2022 tout en gardant son entité juridique et ses équipes en France.

Evoliz s’accorde à l’artisan, à l’agence ou au prestataire de 1 à 15 personnes qui facture des clients professionnels et veut un seul outil pour devis, factures, trésorerie et achats, sans l’interfacer chaque jour avec un logiciel comptable. La formule Essentielle est à 29 € par mois (1 compte bancaire, 500 documents OCR, devis et factures illimités, Plateforme Agréée incluse), l’Avancée à 49 € (factures récurrentes, relances automatiques, jusqu’à 10 comptes bancaires, axes analytiques, prévisionnel), avec un essai de 15 jours sans carte et l’utilisateur supplémentaire à 9 € par mois. La limite se voit vite dès que le besoin glisse vers les modules RH, la gestion de projet ou un CRM évolué ; Evoliz ne produit pas non plus la liasse fiscale ni le bilan, qui relèvent du logiciel de production comptable.

À l’autre bout de la gamme, Shine Facture joue la simplicité et le prix bas : Evoliz vs Shine Facture mesure ce que l’écart de tarif achète réellement.

4,0/5Note Eurosaas

Henrri : gratuit, puis à partir de 17 € par mois HT

Rares sont les outils de facturation professionnels dont le plan gratuit n’est pas une version d’appel bridée : Henrri en fait partie. Développé par le Groupe Rivalis (société H2R) dans la lignée de ses outils de pilotage pour TPE, il offre gratuitement facturation et devis illimités, utilisateurs illimités, export comptable et accès expert-comptable, sans aucun abonnement. La conformité e-facturation est elle aussi incluse dans le plan gratuit, via la Plateforme Agréée partenaire Pennylane, sans frais ni démarche. Le module Henrri Pay encaisse les clients par QR Code ou lien de paiement directement depuis la facture (commission de 1,2 % et 0,15 € par transaction), sans configuration bancaire, et les serveurs en France rassurent les structures attentives à la souveraineté.

Le plan Pro ne coûte rien (facturation et devis illimités, Plateforme Agréée incluse), l’Expert monte à 17 € par mois HT en annuel (synchronisation bancaire multi-comptes, relances automatiques, signature électronique des devis) et le VIP à 49 € HT (factures d’avancement, récurrentes, Coach Devis IA, jusqu’à 10 IBAN), sans engagement sur les formules mensuelles. Deux réserves à connaître : il n’a pas d’application mobile native, l’accès passe par le navigateur, et les liaisons comptables se font par export de fichiers, avec une étape d’import manuelle côté cabinet. Cela mis à part, Henrri parle au consultant, au développeur indépendant ou à l’artisan qui facture moins d’une vingtaine de clients par mois et refuse tout abonnement, comme au dirigeant multi-structures dont le plan Expert rattache jusqu’à cinq entités et le VIP jusqu’à dix.

3,5/5Note Eurosaas

Tiime : gratuit, puis à partir de 17,99 € HT par mois

Tiime vise les indépendants et très petites structures qui veulent dépasser la simple facturation : son plan payant couvre aussi la comptabilité, le rapprochement bancaire et un compte professionnel intégré, le tout depuis une application mobile native (iOS et Android) que peu de concurrents proposent sur ce segment. Surtout, il est immatriculé directement PDP auprès de la DGFiP, sans passer par un partenaire : les factures Factur-X émises et reçues transitent par sa propre infrastructure, ce qui allège les démarches de conformité 2026. L’offre Free inclut d’ailleurs cette conformité et le support téléphonique, chose rare sur un plan gratuit.

Le micro-entrepreneur et la profession libérale qui travaillent en euros et pilotent tout depuis leur téléphone (factures créées, justificatifs photographiés, expert-comptable branché sans échange de fichiers) sont sa cible naturelle. Le Free est gratuit (facturation illimitée, e-facturation PDP, support téléphonique), le Smart passe à 17,99 € HT par mois (comptabilité, rapprochement bancaire, compte pro, multi-utilisateurs) et le Business à 24,99 € HT (reporting avancé), deux mois d’essai à la clé. La frontière tient à l’international : Tiime ne gère que l’euro et ses intégrations tierces restent rares, Sellsy en tête. Une API ouverte reste disponible pour les développeurs.

4,0/5Note Eurosaas

Axonaut : à partir de 48,50 € par mois

Axonaut occupe une place à part dans cette sélection : c’est un ERP léger qui réunit CRM, facturation, trésorerie, achats, gestion de projet, RH et SAV dans un même outil. Sa logique tarifaire est singulière, puisque toutes les fonctionnalités sont accessibles dès le premier plan, quel que soit l’engagement : seuls le nombre d’utilisateurs et la durée d’engagement font varier le prix. La surface couverte dépasse donc nettement celle d’un outil de facturation pure, avec les relances automatiques, les campagnes d’emailing, les tickets SAV, le compte pro à IBAN français et les cartes Mastercard, tous inclus. Les intégrations natives (Stripe, GoCardless, PayPal, URSSAF, Gmail, Outlook, LinkedIn) et la passerelle Zapier, qui ouvre l’accès à des milliers d’applications, couvrent la quasi-totalité des besoins d’interconnexion d’une PME.

Une agence de communication de cinq personnes, avec des clients récurrents, des projets à jalons et des notes de frais à valider chaque mois, y trouvera l’outil qui remplacera le plus de briques dans sa pile logicielle. Un indépendant aux besoins simples ne justifie en revanche ni cette richesse ni le ticket d’entrée pour dix factures par mois, et une structure déjà équipée d’un CRM solide comme Salesforce ou HubSpot jugera le module d’Axonaut trop léger pour migrer. Les tarifs suivent l’engagement : 48,50 € par mois et par utilisateur sur deux ans, 58,20 € sur un an, 97 € sans engagement, fonctionnalités complètes et essai gratuit dans tous les cas.

3,9/5Note Eurosaas

Sellsy : à partir de 39 € par mois

Sellsy est le seul outil de cette sélection conçu dès l’origine comme une combinaison de facturation et de CRM. Là où les autres ont ajouté un module commercial par-dessus leur cœur de facturation, Sellsy réunit les deux dans une seule base : chaque contact, chaque opportunité, chaque devis et chaque facture sont liés. Suivre le cycle de vente complet, de la prospection au paiement, dans un même outil réduit d’autant les ressaisies et les erreurs de facturation pour une équipe commerciale ; la facturation récurrente et la gestion des abonnements arrivent dès le plan Standard, et les données sont hébergées en France, dans des centres de données certifiés ISO 27001.

Le plan Standard s’affiche à 39 € par mois et par utilisateur (CRM, devis, facturation, relances, campagnes email et SMS), l’Evolution à 59 € (reporting avancé, support téléphonique, Sellsy IA illimité), l’Elite à 79 € (droits avancés, stockage illimité, chargé de compte dédié). Sans équipe commerciale, ou sur un cycle de vente court et transactionnel comme l’e-commerce ou l’artisanat, le CRM intégré apporte peu : un outil de facturation pure sera moins cher et plus rapide à prendre en main. Il prend en revanche tout son sens pour la PME de services (conseil, agence, ESN) dotée d’une équipe commerciale de 2 à 10 personnes qui veut aligner vente et facturation dans une seule base et laisser ses commerciaux transformer eux-mêmes leurs devis en factures.

Le recouvrement entre facturation et pilotage comptable explique l’hésitation fréquente avec Pennylane : Pennylane vs Sellsy sépare ce qui relève de la comptabilité et ce qui relève de la vente.

3,7/5Note Eurosaas

Karlia : à partir de 29 € HT par mois

Créé à Lyon en 2021, Karlia réunit CRM, devis, factures, suivi de trésorerie et gestion de projet dans une même interface. Là où Pennylane part de la comptabilité et Sellsy du CRM, Karlia s’adresse aux PME qui veulent réduire le nombre d’outils, avec une spécialisation nette pour le BTP et la rénovation énergétique : la facturation électronique et les flux MaPrimeRénov et CEE y sont intégrés nativement, répondant aux obligations propres au secteur. Les signatures électroniques passent par Yousign, et les données sont hébergées en France, en infogérance française, sans transfert hors UE.

Karlia trouve son public dans la PME de services, du BTP ou de la rénovation énergétique qui jongle avec le multi-TVA ou les dossiers CEE et veut piloter le pipeline commercial, la facturation et la trésorerie sans empiler les logiciels. Pour un indépendant ou une micro-entreprise au seul besoin de facturation, cette richesse (CRM, projets, trésorerie) se paie et reste largement sous-exploitée. Les tarifs s’entendent par utilisateur et par mois HT : Pro à 29 €, Entreprise à 49 €, Privilège à 69 €.

3,6/5Note Eurosaas

Indy : gratuit, puis à partir de 9 € HT par mois

Indy est une solution de comptabilité en ligne pensée d’abord pour les indépendants : micro-entreprises, entreprises individuelles, sociétés (SAS, SASU, SARL, EURL), SCI et LMNP. Son cœur n’est pas la facturation mais la synchronisation bancaire automatique, qui classe les transactions sans saisie ; la facturation vient compléter un cycle qui va jusqu’aux déclarations fiscales. L’agrégateur bancaire est agréé ACPR, les données sont hébergées dans l’UE (Allemagne, France, Irlande), et Indy est immatriculée Plateforme de Dématérialisation Partenaire auprès de la DGFiP.

Une PME avec une équipe commerciale ou des besoins de gestion avancés trouvera l’outil trop juste : Indy ne quitte pas le terrain de la comptabilité de l’indépendant, sans CRM ni pilotage de pipeline. La grille reste simple : Essentiel gratuit, Plus à partir de 9 € HT par mois, Premium à partir de 15 € HT par mois, en facturation annuelle. À ce tarif, le freelance, la profession libérale en BNC ou la petite société qui mène sa comptabilité, sa facturation et ses déclarations en autonomie, sans expert-comptable au quotidien, tient là un outil taillé pour lui.

4,0/5Note Eurosaas

Teamleader : à partir de 37,50 € par mois

Développé en Belgique, Teamleader réunit CRM, devis, projets et facturation pour les TPE et PME qui veulent un tout-en-un sans basculer dans une suite ERP. C’est, avec Sellsy, l’autre outil de cette sélection à mettre la relation commerciale au même niveau que la facturation. Son approche est modulaire : CRM, gestion de projet et facturation s’activent selon les besoins, et le suivi du temps passé comme le pilotage de projet, intégrés, parlent aux agences et aux sociétés de services. L’infrastructure est hébergée en Europe, avec des engagements RGPD explicites.

Une agence marketing ou web, ou toute société de services de quelques personnes qui veut relier devis, facturation, temps passé et suivi client dans un même environnement, y gagnera le plus. Les formules, en facturation annuelle et à partir de deux utilisateurs, vont du Smart à 37,50 € par mois au Grow à 49,50 € et au Flow à 67,50 €. Ce plancher à deux utilisateurs le dit assez : Teamleader pense équipe plus que solo, et l’essentiel de sa valeur tient à son volet commercial ; un indépendant au besoin de facturation simple le paierait sans l’exploiter.

3,5/5Note Eurosaas

Shine Facture : gratuit, puis à partir de 9 € HT par mois

Shine Facture est un logiciel de facturation 100 % en ligne, opéré par Shine SAS, établissement de paiement français agréé ACPR. Héritier de Zervant (finlandais, racheté par Ageras et renommé), il cible les indépendants, auto-entrepreneurs, artisans et TPE qui veulent émettre devis, factures et relances sans rien installer. La proposition tient en trois mots : un plan gratuit réellement fonctionnel, une présence dans sept pays européens, un produit pensé pour la simplicité. Shine Facture est par ailleurs Plateforme Agréée, ce qui permet d’émettre et de recevoir des factures électroniques sans surcoût dans le cadre de la réforme.

Le tarif tient en trois lignes : Free gratuit, Start à 9 € HT par mois, Plus à 20 € HT. Une PME avec comptabilité analytique ou besoins de gestion commerciale en verra la frontière : Shine Facture couvre la facturation, pas la comptabilité complète ni le CRM. Mais pour l’auto-entrepreneur, l’artisan ou la TPE en quête d’une facturation gratuite ou peu coûteuse, simple à prendre en main et adossée à un acteur solide du paiement, c’est un point d’entrée difficile à battre.

3,8/5Note Eurosaas

Comment choisir votre logiciel de facturation européen

La réforme de 2026 est le premier filtre. À partir de septembre, émettre une facture B2B sans passer par une PDP ou une Plateforme Agréée partenaire deviendra progressivement non conforme, selon la taille de l’entreprise (2026 pour les grandes entreprises et les ETI, 2027 pour les PME et TPE). Les outils présentés ici sont tous conformes, mais vérifiez que votre contrat inclut bien la composante e-facturation : certains éditeurs la facturent en option. Ce même calendrier pousse les utilisateurs de suites non européennes à changer d’outil, un cas que couvrent les alternatives européennes à QuickBooks.

Vient ensuite la collaboration avec l’expert-comptable. Si vous travaillez avec un cabinet, choisissez un outil qu’il accepte de piloter côté production : Pennylane a le réseau de cabinets partenaires le plus dense en France, mais Evoliz et Tiime offrent aussi des accès dédiés. Un logiciel que votre comptable ne connaît pas allonge la mise en place et peut entraîner des coûts d’accompagnement.

La profondeur fonctionnelle réellement utile tranche le reste. Pour la facturation courante d’un indépendant ou d’une TPE, les outils gratuits ou à bas prix (Henrri, Tiime) suffisent largement. Dès qu’apparaissent des projets à jalons, une équipe commerciale, des achats fournisseurs ou un besoin de trésorerie prévisionnelle, les outils premium (Axonaut, Evoliz Avancée, Pennylane) rentabilisent plus vite leur coût supérieur.

La mobilité, enfin. Pour qui travaille surtout depuis un smartphone (artisan, prestataire en déplacement, commercial itinérant), Tiime et Axonaut offrent des applications mobiles complètes, là où Henrri n’a pas d’application native.

Quel outil selon votre profil ?

Micro-entrepreneur ou freelance sous vingt factures par mois : Henrri ou Tiime, tous deux gratuits, conformes à la réforme et sans courbe d’apprentissage. Tiime ajoute la comptabilité et un compte pro à partir de 17,99 € HT par mois quand l’activité grossit.

Dirigeant d’une TPE ou PME de services avec un expert-comptable actif : Pennylane reste la référence pour cette configuration : sa synchronisation en temps réel avec le cabinet épargne les allers-retours et les erreurs de fin d’exercice.

Artisan, commerçant ou prestataire avec des achats fournisseurs à traiter et un besoin de certification anti-fraude TVA : Evoliz est taillé pour ce profil, double certification NF et module d’achats OCR à l’appui.

Équipe commerciale à réunir avec la facturation : Sellsy s’impose : la convergence des données de vente et de facturation dans un seul outil supprime les copier-coller entre deux logiciels.

Structure qui veut remplacer plusieurs logiciels d’un coup (facturation, CRM, trésorerie, RH, projet) et compte plusieurs utilisateurs : Axonaut devient pertinent malgré son tarif d’entrée plus élevé.

Pour explorer d’autres options selon votre secteur, parcourez l’ensemble des logiciels de facturation et de gestion commerciale européens référencés sur Eurosaas. Et comme l’échéance de la facturation électronique B2B approche, c’est le moment de vérifier que votre outil actuel est conforme : notre guide Facturation électronique : êtes-vous prêt pour le 1er septembre 2026 ? détaille les obligations selon votre statut.

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