10 meilleurs logiciels de facturation européens pour PME et indépendants en 2026

En France, le logiciel de facturation a changé de statut : ce n’est plus un simple confort de gestion, c’est devenu une échéance. À partir du 1er septembre 2026, une facture entre professionnels devra transiter par une Plateforme Agréée par l’administration, et un outil qui n’y est pas raccordé ne pourra tout bonnement plus servir à facturer en B2B.

Le calendrier est progressif : réception pour toutes les entreprises et émission pour les grandes et les ETI en 2026, émission pour les PME et TPE en 2027. Le choix de l’outil, longtemps reportable, a donc pris un caractère d’urgence.

Les dix logiciels de facturation européens réunis ici sont tous prêts pour l’échéance, édités et hébergés dans l’Union. Au-delà de la conformité, ils se départagent sur l’essentiel : facturation simple, gestion commerciale, comptabilité intégrée, collaboration avec l’expert-comptable. Fiches détaillées et tarifs vérifiés à l’appui.

Comment ces outils ont été sélectionnés

Chaque logiciel retenu répond à cinq critères : entité juridique et hébergement des données dans l’Union européenne (conformité RGPD), conformité à la réforme de facturation électronique 2026 (PDP immatriculée ou Plateforme Agréée partenaire), tarif accessible aux TPE et PME françaises, version gratuite ou essai sans carte bancaire, et fonctionnalités de base vérifiées sur les pages éditeur. Les solutions purement enterprise ou centrées sur les dépenses fournisseurs (AP) sont restées hors périmètre.

Tableau comparatif

Outil	Note	Point fort	À partir de	Essai gratuit	Site	Fiche
Pennylane	3,9/5	Collaboration expert-comptable en temps réel	14 € par mois	Oui	pennylane.com	Voir la fiche
Evoliz	4,0/5	Double certification NF, hébergement France	29 € par mois	15 jours sans CB	evoliz.com	Voir la fiche
Henrri	3,5/5	Plan gratuit permanent et illimité	Gratuit	Oui (plan Free)	henrri.com	Voir la fiche
Tiime	4,0/5	PDP immatriculée DGFiP, facturation illimitée gratuite	Gratuit	Oui (plan Free)	tiime.fr	Voir la fiche
Axonaut	3,9/5	ERP léger tout-en-un, fonctionnalités illimitées dès le premier plan	48,50 € par mois	Oui	axonaut.com	Voir la fiche
Sellsy	3,7/5	Facturation + CRM nativement intégrés	39 € par mois	Oui	sellsy.com	Voir la fiche
Karlia	3,6/5	CRM, facturation et trésorerie réunis	29 € HT par mois	Oui (sans CB)	karlia.co	Voir la fiche
Indy	4,0/5	Compta + facturation pour indépendants	Gratuit	Oui (plan gratuit)	indy.fr	Voir la fiche
Teamleader	3,5/5	CRM, devis et projets pour PME	37,50 € par mois	Oui	teamleader.eu	Voir la fiche
Shine Facture	3,8/5	Facturation simple, plan gratuit	Gratuit	Oui (plan Free)	shine.fr	Voir la fiche
Finom	3,9/5	Compte professionnel et facturation réunis	Gratuit	Oui	finom.co	Voir la fiche
Fonoa	3,4/5	Automatisation de la TVA et de la facturation électronique par API	Sur devis	Démo	fonoa.com	Voir la fiche
iPaidThat	3,4/5	OCR des factures fournisseurs, plateforme agréée	59 € par mois	Oui	ipaidthat.io	Voir la fiche

Finom, Fonoa et iPaidThat complètent l’annuaire sur des usages plus spécialisés (compte pro et facturation, automatisation de la TVA par API, traitement des factures fournisseurs) : leurs fiches en détaillent le positionnement et les tarifs.

Pennylane : à partir de 14 € par mois

Pennylane est la solution la plus implantée dans les PME françaises suivies par un expert-comptable. Facturation, synchronisation bancaire et production comptable cohabitent dans une même interface : le dirigeant et son cabinet travaillent sur les mêmes données, en temps réel, sans le moindre échange de fichiers. La synchronisation via API PSD2 couvre presque toutes les banques françaises et européennes, néobanques comprises (Qonto, Shine, N26) ; les factures émises sont conformes Factur-X ; et Pennylane est immatriculée PDP auprès de la DGFiP, ce qui veut dire que la facturation électronique B2B y est gérée en propre, sans passer par un tiers. Certification ISO 27001 et hébergement dans l’UE achèvent le volet souveraineté.

C’est l’outil d’une SASU ou d’une SARL de services (conseil, agence, éditeur de logiciels) de trois à vingt personnes, dont le dirigeant veut suivre sa trésorerie en temps réel et garder son expert-comptable sur la même interface, sans rien exporter en fin de mois. Un micro-entrepreneur encore sans cabinet, lui, n’en exploitera qu’une partie : tout l’outil est bâti autour de cette collaboration. Côté tarifs, le plan Basique est à 14 € par mois (facturation et synchronisation bancaire), l’Essentiel à 24 € (relances automatiques, plus de 60 intégrations, budget prévisionnel), le Premium avec module comptable à 79 € (production comptable, liasse fiscale, révision) ; ce dernier est souvent réservé aux cabinets partenaires, mieux vaut donc vérifier l’accès direct selon votre situation.

3,9/5Note Eurosaas

Evoliz : à partir de 29 € par mois

Installé à La Garde (Var), Evoliz vise les artisans, commerçants et prestataires qui veulent remplacer le trio tableur, logiciel de facturation et outil bancaire séparés. Sa double certification NF203 et NF525, rare sur le marché français, couvre les obligations de la loi anti-fraude TVA et fait l’objet d’un audit annuel. La Plateforme Agréée DGFiP est incluse dans toutes les formules, la moins chère comprise, avec prise en charge du Factur-X à l’émission comme à la réception, et le traitement des factures fournisseurs par OCR (500 documents par mois en formule Essentielle) évite la ressaisie. L’éditeur a rejoint le groupe européen Visma en 2022 tout en gardant son entité juridique et ses équipes en France.

Le profil type : un artisan, une agence ou un prestataire de 1 à 15 personnes qui facture des clients professionnels et veut un seul outil pour les devis, les factures, la trésorerie et les achats, sans l’interfacer chaque jour avec un logiciel comptable. Ses limites se voient vite dès qu’on cherche des modules RH, de la gestion de projet ou un CRM évolué ; Evoliz ne produit pas non plus la liasse fiscale ni le bilan, qui restent du ressort du logiciel de production comptable. La formule Essentielle est à 29 € par mois (1 compte bancaire, 500 documents OCR, devis et factures illimités, Plateforme Agréée incluse), l’Avancée à 49 € (factures récurrentes, relances automatiques, jusqu’à 10 comptes bancaires, axes analytiques, prévisionnel) ; essai gratuit de 15 jours sans carte, utilisateur supplémentaire à 9 € par mois.

4,0/5Note Eurosaas

Henrri : gratuit, puis à partir de 17 € par mois HT

Rares sont les outils de facturation professionnels dont le plan gratuit n’est pas une version d’appel bridée : Henrri en fait partie. Développé par le Groupe Rivalis (société H2R) dans la lignée de ses outils de pilotage pour TPE, il offre gratuitement facturation et devis illimités, utilisateurs illimités, export comptable et accès expert-comptable, sans aucun abonnement. La conformité e-facturation est elle aussi incluse dans le plan gratuit, via la Plateforme Agréée partenaire Pennylane, sans frais ni démarche. Le module Henrri Pay encaisse les clients par QR Code ou lien de paiement directement depuis la facture (commission de 1,2 % et 0,15 € par transaction), sans configuration bancaire, et les serveurs en France rassurent les structures attentives à la souveraineté.

Henrri convient au consultant, au développeur indépendant ou à l’artisan qui facture moins d’une vingtaine de clients par mois et refuse de payer un abonnement, comme au dirigeant qui pilote plusieurs petites structures : le plan Expert rattache jusqu’à 5 entités au même accès, le VIP jusqu’à 10. Il atteint sa limite faute d’application mobile native, l’accès passant par le navigateur, et les liaisons avec les logiciels comptables tiers se font par export de fichiers, donc avec une étape d’import manuelle côté cabinet. Le plan Pro est à 0 € (facturation et devis illimités, Plateforme Agréée incluse), l’Expert à 17 € par mois HT en annuel (synchronisation bancaire multi-comptes, relances automatiques, signature électronique des devis), le VIP à 49 € HT (factures d’avancement, récurrentes, Coach Devis IA, jusqu’à 10 IBAN), sans engagement sur les formules mensuelles.

3,5/5Note Eurosaas

Tiime : gratuit, puis à partir de 17,99 € HT par mois

Tiime vise les indépendants et très petites structures qui veulent dépasser la simple facturation : son plan payant couvre aussi la comptabilité, le rapprochement bancaire et un compte professionnel intégré, le tout depuis une application mobile native (iOS et Android) que peu de concurrents proposent sur ce segment. Surtout, il est immatriculé directement PDP auprès de la DGFiP, sans passer par un partenaire : les factures Factur-X émises et reçues transitent par sa propre infrastructure, ce qui allège les démarches de conformité 2026. L’offre Free inclut d’ailleurs cette conformité et le support téléphonique, chose rare sur un plan gratuit.

L’outil parle au micro-entrepreneur ou à la profession libérale qui facture des clients français en euros, veut créer ses factures et photographier ses justificatifs depuis son téléphone, et brancher un expert-comptable sans échange de fichiers. Il s’arrête là où commence l’international : Tiime ne gère que l’euro, et ses intégrations tierces sont peu nombreuses (Sellsy en tête, plus une API ouverte pour les développeurs). Le plan Free est à 0 € (facturation illimitée, e-facturation PDP, support téléphonique), le Smart à 17,99 € HT par mois (comptabilité, rapprochement bancaire, compte pro, multi-utilisateurs), le Business à 24,99 € HT (reporting avancé), avec deux mois d’essai sur les formules payantes.

4,0/5Note Eurosaas

Axonaut : à partir de 48,50 € par mois

Axonaut occupe une place à part dans cette sélection : c’est un ERP léger qui réunit CRM, facturation, trésorerie, achats, gestion de projet, RH et SAV dans un même outil. Sa logique tarifaire est singulière, puisque toutes les fonctionnalités sont accessibles dès le premier plan, quel que soit l’engagement : seuls le nombre d’utilisateurs et la durée d’engagement font varier le prix. La surface couverte dépasse donc nettement celle d’un outil de facturation pure, avec les relances automatiques, les campagnes d’emailing, les tickets SAV, le compte pro à IBAN français et les cartes Mastercard, tous inclus. Les intégrations natives (Stripe, GoCardless, PayPal, URSSAF, Gmail, Outlook, LinkedIn) et la passerelle Zapier, qui ouvre l’accès à des milliers d’applications, couvrent la quasi-totalité des besoins d’interconnexion d’une PME.

Une agence de communication de cinq personnes, avec des clients récurrents, des projets à jalons et des notes de frais à valider chaque mois, y trouvera sans doute l’outil qui en remplacera le plus dans sa pile logicielle. À l’inverse, un indépendant aux besoins simples ne justifie ni cette richesse ni le ticket d’entrée à 48,50 € pour dix factures par mois, et une structure déjà équipée d’un CRM solide (Salesforce, HubSpot) jugera sans doute le module CRM d’Axonaut trop léger pour migrer. Les tarifs suivent l’engagement : 48,50 € par mois et par utilisateur sur deux ans, 58,20 € sur un an, 97 € sans engagement, fonctionnalités complètes dans tous les cas. Essai gratuit disponible.

3,9/5Note Eurosaas

Sellsy : à partir de 39 € par mois

Sellsy est le seul outil de cette sélection conçu dès l’origine comme une combinaison de facturation et de CRM. Là où les autres ont ajouté un module commercial par-dessus leur cœur de facturation, Sellsy réunit les deux dans une seule base : chaque contact, chaque opportunité, chaque devis et chaque facture sont liés. Suivre le cycle de vente complet, de la prospection au paiement, dans un même outil réduit d’autant les ressaisies et les erreurs de facturation pour une équipe commerciale ; la facturation récurrente et la gestion des abonnements arrivent dès le plan Standard, et les données sont hébergées en France, dans des centres de données certifiés ISO 27001.

Le bon candidat est une PME de services (conseil, agence, ESN) dotée d’une équipe commerciale de 2 à 10 personnes, qui veut aligner vente et facturation sans entretenir deux outils, et laisser ses commerciaux transformer eux-mêmes leurs devis en factures sans repasser par l’administratif. Sans équipe commerciale, ou sur un cycle de vente court et transactionnel (e-commerce, artisanat), le CRM intégré apporte peu : un outil de facturation pure sera moins cher et plus rapide à prendre en main. Le plan Standard est à 39 € par mois et par utilisateur (CRM, devis, facturation, relances, campagnes email et SMS), l’Evolution à 59 € (reporting avancé, support téléphonique, Sellsy IA illimité), l’Elite à 79 € (droits avancés, stockage illimité, chargé de compte dédié).

3,7/5Note Eurosaas

Karlia : à partir de 29 € HT par mois

Créé à Lyon en 2021, Karlia réunit CRM, devis, factures, suivi de trésorerie et gestion de projet dans une même interface. Là où Pennylane part de la comptabilité et Sellsy du CRM, Karlia s’adresse aux PME qui veulent réduire le nombre d’outils, avec une spécialisation nette pour le BTP et la rénovation énergétique : la facturation électronique et les flux MaPrimeRénov et CEE y sont intégrés nativement, répondant aux obligations propres au secteur. Les signatures électroniques passent par Yousign, et les données sont hébergées en France, en infogérance française, sans transfert hors UE.

Il vise une PME de services, du BTP ou de la rénovation énergétique qui jongle avec le multi-TVA ou les dossiers CEE et veut piloter pipeline commercial, facturation et trésorerie sans empiler les logiciels. Pour un indépendant ou une micro-entreprise au seul besoin de facturation, en revanche, cette richesse (CRM, projets, trésorerie) se paie et reste largement sous-exploitée. Les tarifs s’entendent par utilisateur et par mois HT : Pro à 29 €, Entreprise à 49 €, Privilège à 69 €.

3,6/5Note Eurosaas

Indy : gratuit, puis à partir de 9 € HT par mois

Indy est une solution de comptabilité en ligne pensée d’abord pour les indépendants : micro-entreprises, entreprises individuelles, sociétés (SAS, SASU, SARL, EURL), SCI et LMNP. Son cœur n’est pas la facturation mais la synchronisation bancaire automatique, qui classe les transactions sans saisie ; la facturation vient compléter un cycle qui va jusqu’aux déclarations fiscales. L’agrégateur bancaire est agréé ACPR, les données sont hébergées dans l’UE (Allemagne, France, Irlande), et Indy est immatriculée Plateforme de Dématérialisation Partenaire auprès de la DGFiP.

Le freelance, la profession libérale en BNC ou la petite société qui veut gérer comptabilité, facturation et déclarations en autonomie, sans expert-comptable au quotidien, y est à sa place. Une PME dotée d’une équipe commerciale ou de besoins de gestion avancée le sera moins : Indy reste centré sur la comptabilité de l’indépendant, sans CRM ni pilotage de pipeline. La grille est simple : Essentiel gratuit, Plus à partir de 9 € HT par mois, Premium à partir de 15 € HT par mois, en facturation annuelle.

4,0/5Note Eurosaas

Teamleader : à partir de 37,50 € par mois

Développé en Belgique, Teamleader réunit CRM, devis, projets et facturation pour les TPE et PME qui veulent un tout-en-un sans basculer dans une suite ERP. C’est, avec Sellsy, l’autre outil de cette sélection à mettre la relation commerciale au même niveau que la facturation. Son approche est modulaire : CRM, gestion de projet et facturation s’activent selon les besoins, et le suivi du temps passé comme le pilotage de projet, intégrés, parlent aux agences et aux sociétés de services. L’infrastructure est hébergée en Europe, avec des engagements RGPD explicites.

Une agence marketing ou web, une société de services de quelques personnes qui veut relier devis, facturation, temps passé et suivi client dans un même environnement, en tirera le meilleur. Pour un indépendant ou une TPE au besoin de facturation simple, le ticket d’entrée à deux utilisateurs minimum vise plutôt les équipes que le solo, et l’essentiel de la valeur de Teamleader tient à son volet commercial. Les formules, en facturation annuelle et à partir de deux utilisateurs, vont du Smart à 37,50 € par mois au Grow à 49,50 € et au Flow à 67,50 €.

3,5/5Note Eurosaas

Shine Facture : gratuit, puis à partir de 9 € HT par mois

Shine Facture est un logiciel de facturation 100 % en ligne, opéré par Shine SAS, établissement de paiement français agréé ACPR. Héritier de Zervant (finlandais, racheté par Ageras et renommé), il cible les indépendants, auto-entrepreneurs, artisans et TPE qui veulent émettre devis, factures et relances sans rien installer. La proposition tient en trois mots : un plan gratuit réellement fonctionnel, une présence dans sept pays européens, un produit pensé pour la simplicité. Shine Facture est par ailleurs Plateforme Agréée, ce qui permet d’émettre et de recevoir des factures électroniques sans surcoût dans le cadre de la réforme.

L’outil s’adresse à l’auto-entrepreneur, à l’artisan ou à la TPE en quête d’une facturation gratuite ou peu coûteuse, simple à prendre en main et adossée à un acteur solide du paiement. Une PME avec comptabilité analytique ou besoins de gestion commerciale verra vite la frontière : Shine Facture couvre la facturation, pas la comptabilité complète ni le CRM. La grille se résume à trois lignes : Free gratuit, Start à 9 € HT par mois, Plus à 20 € HT.

3,8/5Note Eurosaas

Comment choisir votre logiciel de facturation européen

La réforme de 2026 est le premier filtre. À partir de septembre, émettre une facture B2B sans passer par une PDP ou une Plateforme Agréée partenaire deviendra progressivement non conforme, selon la taille de l’entreprise (2026 pour les grandes entreprises et les ETI, 2027 pour les PME et TPE). Les outils présentés ici sont tous conformes, mais vérifiez que votre contrat inclut bien la composante e-facturation : certains éditeurs la facturent en option.

Vient ensuite la collaboration avec l’expert-comptable. Si vous travaillez avec un cabinet, choisissez un outil qu’il accepte de piloter côté production : Pennylane a le réseau de cabinets partenaires le plus dense en France, mais Evoliz et Tiime offrent aussi des accès dédiés. Un logiciel que votre comptable ne connaît pas allonge la mise en place et peut entraîner des coûts d’accompagnement.

La profondeur fonctionnelle réellement utile tranche le reste. Pour la facturation courante d’un indépendant ou d’une TPE, les outils gratuits ou à bas prix (Henrri, Tiime) suffisent largement. Dès qu’apparaissent des projets à jalons, une équipe commerciale, des achats fournisseurs ou un besoin de trésorerie prévisionnelle, les outils premium (Axonaut, Evoliz Avancée, Pennylane) rentabilisent plus vite leur coût supérieur.

La mobilité, enfin. Pour qui travaille surtout depuis un smartphone (artisan, prestataire en déplacement, commercial itinérant), Tiime et Axonaut offrent des applications mobiles complètes, là où Henrri n’a pas d’application native.

Quel outil selon votre profil ?

Micro-entrepreneur ou freelance sous vingt factures par mois : Henrri ou Tiime, tous deux gratuits, conformes à la réforme et sans courbe d’apprentissage. Tiime ajoute la comptabilité et un compte pro à partir de 17,99 € HT par mois quand l’activité grossit.

Dirigeant d’une TPE ou PME de services avec un expert-comptable actif : Pennylane reste la référence pour cette configuration : sa synchronisation en temps réel avec le cabinet épargne les allers-retours et les erreurs de fin d’exercice.

Artisan, commerçant ou prestataire avec des achats fournisseurs à traiter et un besoin de certification anti-fraude TVA : Evoliz est taillé pour ce profil, double certification NF et module d’achats OCR à l’appui.

Équipe commerciale à réunir avec la facturation : Sellsy s’impose : la convergence des données de vente et de facturation dans un seul outil supprime les copier-coller entre deux logiciels.

Structure qui veut remplacer plusieurs logiciels d’un coup (facturation, CRM, trésorerie, RH, projet) et compte plusieurs utilisateurs : Axonaut devient pertinent malgré son tarif d’entrée plus élevé.

Pour explorer d’autres options selon votre secteur, parcourez l’ensemble des logiciels de facturation et de gestion commerciale européens référencés sur Eurosaas. Et comme l’échéance de la facturation électronique B2B approche, c’est le moment de vérifier que votre outil actuel est conforme : notre guide Facturation électronique : êtes-vous prêt pour le 1er septembre 2026 ? détaille les obligations selon votre statut.

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